Los Capibaras o Chigüiros pueden vivir en diversos tipos de hábitat, pero prefieren estar cerca del agua como en ríos, lagos, marismas y manglares, aunque también se les puede ver se zonas secas y áridas como sábanas o en áreas de hierbas.

En Colombia se le puede encontrar en los Andes por las zonas de eje cafetero, los llanos orientales, el magdalena e incluso en el Amazonas. Les gusta estar cerca de los ríos Magdalena y Orinoco, son una especie considerada Patrimonio Natural.